黑锹小角（小林昭二饰）率领的忍者军团行动失败，柳生鞘香（松尾嘉代饰）带领其麾下的女子刺客军团继续追踪拜一刀父子的踪迹。阿波藩的蓝玉制造密法被幕府盗走，拜一刀（若山富三郎饰）受聘刺杀盗走密法之人。一路上

柳生一族贼心不死，沿途派遣数队刺客截杀拜一刀父子，但最后悉数落败。　　这一日父子俩投宿旅店，一名叫松女子跑来寻求帮助，拜一刀（若山富三郎饰）手刃前来追赶之人。闻讯赶来的妓院老板酉藏（浜木锦子饰）索人，

幕府时代，公仪介错人（为剖腹者斩首的刽子手）拜一刀（若山富三郎饰）执行上层命令，为年幼的地方领主斩首。归来后梦见妻女被人所杀，心生不祥预感。柳生手下拜访拜一刀，看见堂中为断头者摆放的灵位，遂以谋反罪名

元和九年（1623年），德川第二代将军秀忠在江户大奥内暴卒，其死因尚未查明，下任将军继承人的问题旋即便被摆上台面。秀忠生前宠爱幼子忠长（西郷輝彦饰），京都皇族也对其甚为看好，故而江户多数大臣全力拥护忠

明朝中叶，倭寇不断骚扰东南沿海，东瀛柳生一族辅佐德川家康之余亦要席卷中原武林。于是“东瀛霸刀”柳生（任达华饰）杀入武林、所向披靡，亦要向中原武林第一高手“天剑”独孤无极（刘松仁饰）挑战。独孤无极正要与